Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1470.7 ms