Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CABP4P57796 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CABP4P57796 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CABP4P57796 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CABP4P57796 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CABP4P57796 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CABP4P57796 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CABP4P57796 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms