Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA9P57773 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms