Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms