Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGDP52209 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGDP52209 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGDP52209 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGDP52209 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGDP52209 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGDP52209 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGDP52209 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGDP52209 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGDP52209 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGDP52209 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PGDP52209 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGDP52209 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms