Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms