Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms