Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP3P42574 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP3P42574 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP3P42574 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP3P42574 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP3P42574 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP3P42574 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP3P42574 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP3P42574 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP3P42574 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP3P42574 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP3P42574 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP3P42574 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP3P42574 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP3P42574 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP3P42574 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms