Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms