Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJA4P35212 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms