Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms