Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms