Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO2P25791 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms