Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRGP23470 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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