Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPREP23469 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPREP23469 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPREP23469 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPREP23469 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPREP23469 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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