Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms