Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms