Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms