Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODC1P11926 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODC1P11926 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODC1P11926 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODC1P11926 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODC1P11926 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODC1P11926 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODC1P11926 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms