Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms