Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms