Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PKHD1P08F94 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PKHD1P08F94 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PKHD1P08F94 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PKHD1P08F94 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PKHD1P08F94 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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PKHD1P08F94 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PKHD1P08F94 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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