Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSLP07711 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSLP07711 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSLP07711 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSLP07711 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSLP07711 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSLP07711 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms