Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPBP07199 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPBP07199 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms