Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNB1P01574 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms