Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3BO95985 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms