Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms