Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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