Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP4O75161 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms