Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX1O43812 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX1O43812 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX1O43812 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms