Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNJ1O43426 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms