Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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