Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms