Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VSTM2BA6NLU5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms