Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms