Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms