Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C2

EMILIN1, EMILIN-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN1Q9Y6C2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms