Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms