Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms