Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms