Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms