Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3Q9UJ98 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms