Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms