Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms