Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms