Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMMD8Q9NX08 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms