Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MID1IP1Q9NPA3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms