Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms