Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR88Q9GZN0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms