Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms